for /f "tokens=*" %d in ('"dir /b/s/a | findstr /r \.svn$"') do rmdir /q/s "%d"
http://dara-j.asablo.jp/blog/2008/08/04/3671839リストを取り出してバッチもあり。
これだとsvnだけとりだす逆パターンもあり。
for /f "tokens=*" %d in ('"dir /b/s/a | findstr /r \.svn$"') do echo %d >>list.txt